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科研進(jìn)展

真菌直線(xiàn)型四環(huán)混源萜生物合成機制研究獲進(jìn)展

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時(shí)間:2024-03-13  作者:LMB  來(lái)源:文本大?。骸?a href="javascript:doZoom(16)">大 |  | 】  【打印

近日,中國科學(xué)院南海海洋研究所熱帶海洋生物資源與生態(tài)重點(diǎn)實(shí)驗室(LMB)閆巖研究員團隊在真菌直線(xiàn)型四環(huán)混源萜ochraceopones的生物合成與酶反應機制研究方面取得新進(jìn)展,相關(guān)成果“An Enzymatic Carbon-Carbon Bond Cleavage and Aldol Reaction Cascade Converts an Angular Scaffold into the Linear Tetracyclic Core of Ochraceopones”在線(xiàn)發(fā)表于A(yíng)ngewandte Chemie International Edition(《德國應用化學(xué)》)。助理研究員李艷芹、碩士叢夢(mèng)靜為共同第一作者,研究員閆巖、王俊鋒與張長(cháng)生為共同通訊作者。

混源萜(meroterpenoids)是一類(lèi)部分分子骨架來(lái)源于萜烯的天然產(chǎn)物,它們具有復雜多樣的化學(xué)結構及廣泛的生物學(xué)活性。這些豐富的骨架結構既可能來(lái)源于萜烯部分多樣化的重排與環(huán)化,也可能來(lái)源于其非萜烯部分如聚酮、吲哚、莽草酸等豐富的后修飾。因此其生物合成途徑中可能蘊含了大量新穎的酶促化學(xué)反應機制,深入研究這些酶學(xué)機制將為我們創(chuàng )建具有新型骨架結構和生物學(xué)活性的藥物先導提供基礎。真菌直線(xiàn)型四環(huán)混源萜ochraceopones具有優(yōu)異的抗病毒和抗炎活性,然而其由常見(jiàn)的四元折線(xiàn)型結構轉化為獨特的直線(xiàn)型結構所涉及的化學(xué)合成和酶學(xué)反應機制卻極具挑戰性。

研究團隊早期從一株南極土壤來(lái)源真菌Aspergillus ochraceopetaliformis?SCSIO 05702中分離得到了一類(lèi)四環(huán)混源萜類(lèi)化合物ochraceopones(化合物1-4,7)(J Nat Prod, 2016,79:59-65)?;诨蚪M學(xué)及生物信息學(xué)分析定位了負責該類(lèi)化合物生物合成的基因簇(圖1),通過(guò)構建構巢曲霉異源表達體系,聯(lián)合體外微粒體實(shí)驗及蛋白表達,成功鑒定和表征了負責化合物ochraceopones形成的所有生物合成酶,并闡明了完整的生物合成途徑(圖2)。

圖1. 直線(xiàn)型四環(huán)混源萜ochraceopones的生物合成基因簇

圖2. 直線(xiàn)型四環(huán)混源萜ochraceopones的生物合成途徑推測

在這項研究中,研究團隊證明了ochraceopones的線(xiàn)性四環(huán)骨架是由同一個(gè)折線(xiàn)型前體即ochraceopone E(7)衍生而來(lái)。通過(guò)體外氘水標記的微粒體實(shí)驗,證實(shí)了化合物7生成16涉及的碳-碳鍵斷裂反應不是自發(fā)進(jìn)行的,而是由多功能細胞色素P450-OchH催化完成。其通過(guò)將C13位羥基形成氧自由后促發(fā)C13-C14鍵斷裂,而后通過(guò)羥基化形成十元環(huán)的中間體18,之后自發(fā)形成化合物16(圖3)。

圖3. OchH的功能表征

為了驗證16作為真實(shí)底物的正確性,研究團隊將16與基因簇內其余后修飾基因在構巢曲霉中進(jìn)行了生物轉化,并通過(guò)體外微粒體與蛋白的聯(lián)合反應證實(shí)了該反應過(guò)程。結果顯示,異構酶OchL通過(guò)催化分子內的羥醛反應將經(jīng)過(guò)多步修飾的碳-碳鍵斷裂形成的十元環(huán)重新連接,形成了一個(gè)新的碳-碳鍵而呈現出最終的線(xiàn)性四環(huán)化合物3(圖4)。

圖4. 三環(huán)到線(xiàn)性四環(huán)骨架ochraceopones的生物轉化表征

然而,在異源表達及體外反應過(guò)程中,除了獲得一系列不能被繼續轉化的途徑副產(chǎn)物如化合物19、19’、21和23之外,均沒(méi)有檢測到反應的真正中間體(圖4)。但是就觀(guān)察到的實(shí)驗結果表明在目前的生物反應體系中,隨著(zhù)氧化后修飾的多步積累,反應的真實(shí)底物在缺乏其后續生物轉化酶的條件下無(wú)法穩定存在??隙ǖ氖?,根據分離到的一系列副產(chǎn)物及對其形成機制的推測,可以確定整個(gè)反應中間過(guò)程存在的真實(shí)性。

總之,本研究鑒定并表征了合成ochraceopones的所有生物合成酶,并證明了完整的生物合成途徑。證實(shí)了ochraceopones類(lèi)化合物是由OchHJGL催化的酶級聯(lián)反應將常見(jiàn)的折線(xiàn)型四環(huán)前體合成獨特線(xiàn)性四環(huán)骨架結構。其中,多功能細胞色素P450-OchH負責催化自由基形成并引發(fā)C-C鍵斷裂和隨后的C12的羥基化,然后OchJ催化C15羥基化和OchG催化C15-OH脫氫。最后,醛縮酶OchL通過(guò)催化分子內羥醛反應導致新的C-C鍵形成而構建最終的線(xiàn)性四環(huán)骨架。OchH和OchL的發(fā)現及其功能闡明將為尋找更多新的P450酶和醛縮酶提供途徑。然而,由于OchL底物的不穩定性,可能需要通過(guò)合成更穩定的底物衍生物來(lái)進(jìn)一步研究其催化機理。

上述研究工作得到了國家重點(diǎn)研發(fā)計劃、海南省科技計劃三亞崖州灣科技城科技創(chuàng )新聯(lián)合項目、國家自然科學(xué)基金、中國科學(xué)院王寬誠率先人才計劃“盧嘉錫國際團隊項目”和海南省自然科學(xué)基金等的資助。

相關(guān)論文信息:Yanqin Li, Mengjing Cong,Wengui Wang, Xiufeng Zhang, Yiguang Zhu, Yongxiang Song, Wenjun Zhang, Hua Xiao, Yonghong Liu, Changsheng Zhang, Junfeng Wang, and Yan Yan. An Enzymatic Carbon-Carbon Bond Cleavage and Aldol Reaction?Cascade Converts an Angular Scaffold into the Linear Tetracyclic Core of Ochraceopones. Angew Chem Int Edit,2024. doi.org/10.1002/anie.202403365

文章鏈接:https://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/anie.202403365

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